El campeonato nacional de Ecuador nació en 1957, más de tres décadas después de la fundación de la Federación Ecuatoriana de Fútbol en 1925, unificando los campeonatos regionales de Guayaquil, Quito y otras provincias en una sola tabla nacional.
Durante buena parte del siglo XX el título se repartió entre clubes de Guayaquil y Quito: Barcelona Sporting Club y Club Sport Emelec construyeron el 'Clásico del Astillero', el partido más importante del fútbol ecuatoriano, mientras Club Deportivo El Nacional dominaba a fines de los años setenta y en los ochenta.
Liga Deportiva Universitaria de Quito (LDU) vivió su época dorada en la década de 2000, coronada en 2008 con un doblete histórico: título nacional y la primera —y hasta ahora única— Copa Libertadores conseguida por un club ecuatoriano.
Desde 2019, LigaPro administra el torneo de forma independiente de la federación, con un formato de dos etapas y gran final que se mantiene, con ajustes, hasta la actualidad. En la década de 2020 emergieron nuevas potencias: Independiente del Valle, con una academia formadora reconocida en Sudamérica, y Sociedad Deportiva Aucas, que en 2022 conquistó su primer título de Serie A tras 79 años de historia.